W Seller Central koszty są w większości z góry określone. Opłata serwisowa za posiadane konto, prowizja od sprzedaży, koszty modelu FBA – o tym wszystkim wiemy z góry.
W modelu Vendor Central warunki są ustalane w formie negocjacji z marketplacem. Wszystkie koszty są ustalane w formie procentowej od obrotu. Najczęstsze opłaty to tzw. damage allowance, czyli szacunkowe koszty zwrotów czy na przykład utylizacji. Możemy również liczyć na automatyczny marketing, a co za tym idzie, wyższe pozycjonowanie produktów. Zredukowane są koszty magazynowania oraz inne koszty pośrednie, np. brak certyfikacji opakowań ista6 czy opłaty celne.